O Laboratório de Proteômica do CeTICS está localizado no prédio do Laboratório Especial
de Toxinologia Aplicada (LETA) do Instituto Butantan e utiliza abordagens de
espectrometria de massas, bioinformáticas e tecnologias relacionadas para a
caracterização qualitativa e quantiativa de proteomas.
As identificações de proteínas submetidas à digestão com enzimas proteolíticas são
realizadas pela busca em bancos de dados públicos e customizados.
O laboratório possui instrumentação e protocolos para o desenvolvimento de projetos de
pesquisa e oferece colaboração e consultoria, além de realizar experimentos para
pesquisadores do Instituto Butantan e outras instituições de pesquisa. Para mais
informações, entre em contato conosco pelo e-mail: leta.espec.massas@butantan.gov.br.
Nos últimos anos, os pesquisadores do laboratório têm mantido um forte programa
de treinamento para estudantes e pós-docs com o objetivo de criar progressivamente
um ambiente acadêmico integrado por projetos voltados para o uso proteômica
baseada em espectrometria de massas com o objetivo de obter uma visão sistêmica
de fenômenos biológicos.
A quantidade e complexidade dos dados gerados pelo laboratório requer uma análise
complexa e pessoal de apoio para atender às necessidades dos projetos de pesquisa
baseados em espectrometria de massas.
O grupo de bioinformática LETA-CeTICS está ativamente envolvido no desenvolvimento
de programas para facilitar a análise e correlação de dados de espectrometria de
massas e informação gerada por abordagens de genômica/transcriptômica, e também
fornece suporte de sistemas e gerenciamento de armazenamento de dados para os
membros do laboratório.
Neste sentido, atualmente uma plataforma de pesquisa interdisciplinar que permite
análises ômicas qualitativas e quantitativas e modelagem matemática de redes de
sinalização (CeTICSdb) está em desenvolvimento no CeTICS.
Análises proteômicas
Q-TOF Ultima API
(Waters) acoplado ao
nano Acquity Ultra
Performance LC (Waters)
MSQ-single
quadrupole
(Thermo)
LTQ-XL+ETD (Thermo)
acoplado a um
nanoLC Ultra 1D Plus
(Eksigent)
LTQ Orbitrap Velos
(Thermo) – nanoLC
PROXEON EASY-nLCII
(Thermo)