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de Pesquisa

Modelagem dinâmica

de mudanças de GTPases homólogas a Ras

GTPases homólogas a Ras apresentam a função biológica de mudanças moleculares binárias, que são unidades modulares recorrentes em redes complexas de sinalização. Desenvolvemos um modelo cinético da mudança K-Ras, o que permitiu a descoberta de mecanismos moleculares subjacentes a alterações fenotípicas específicas nas células tumorais wt-Kras/com amplificação. Simulações com o nosso modelo K-Ras previam que as células Y1 deveriam expressar pelo menos dois GEFs para catalisar a transição KRas-GDP > KRas-GTP mantendo altos níveis basais de [K-Ras-GTP]. Testes experimentais validaram tal previsão: i) células Y1 expressam dois principais GEFs, SOS e RasGRP4 (qRT-PCR); ii) sublinhas clonais de Y1 selecionadas para resistência a FGF2 (Y1FRs), mostrou o seguinte: níveis muito baixos de expressão K-Ras e níveis irrisórios de RasGRP4-GEF [18;19]; iii) o nocaute de sublinhas de Y1 do gene Kras (CRISPR-Cas9) apresentou um fenótipo de tipo normal em cultura e não foi tumorigênico in camundongos tipo Nude [não publicado]. Sugerimos que todas as mudanças homólogas a Ras são acessíveis a modelagens computadorizadas relativamente simples.Sugerimos que todas as mudanças homólogas a Ras são acessíveis a modelagens computadorizadas relativamente simples.Sugerimos que todas as mudanças homólogas a Ras são acessíveis a modelagens computadorizadas relativamente simples.

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