Plataformas

Laboratório
de Proteômica

O Laboratório de Proteômica do CeTICS está localizado no prédio do Laboratório Especial
de Toxinologia Aplicada (LETA) do Instituto Butantan e utiliza abordagens de
espectrometria de massas, bioinformáticas e tecnologias relacionadas para a
caracterização qualitativa e quantiativa de proteomas.
As identificações de proteínas submetidas à digestão com enzimas proteolíticas são
realizadas pela busca em bancos de dados públicos e customizados.
O laboratório possui instrumentação e protocolos para o desenvolvimento de projetos de
pesquisa e oferece colaboração e consultoria, além de realizar experimentos para
pesquisadores do Instituto Butantan e outras instituições de pesquisa. Para mais
informações, entre em contato conosco pelo e-mail: leta.espec.massas@butantan.gov.br.
Nos últimos anos, os pesquisadores do laboratório têm mantido um forte programa
de treinamento para estudantes e pós-docs com o objetivo de criar progressivamente
um ambiente acadêmico integrado por projetos voltados para o uso proteômica
baseada em espectrometria de massas com o objetivo de obter uma visão sistêmica
de fenômenos biológicos.
A quantidade e complexidade dos dados gerados pelo laboratório requer uma análise
complexa e pessoal de apoio para atender às necessidades dos projetos de pesquisa
baseados em espectrometria de massas.
O grupo de bioinformática LETA-CeTICS está ativamente envolvido no desenvolvimento
de programas para facilitar a análise e correlação de dados de espectrometria de
massas e informação gerada por abordagens de genômica/transcriptômica, e também
fornece suporte de sistemas e gerenciamento de armazenamento de dados para os
membros do laboratório.
Neste sentido, atualmente uma plataforma de pesquisa interdisciplinar que permite
análises ômicas qualitativas e quantitativas e modelagem matemática de redes de
sinalização (CeTICSdb) está em desenvolvimento no CeTICS.

Equipe

  • Cientistas do grupo
    Solange Maria de Toledo Serrano
    Julia Pinheiro Chagas da Cunha
    Leo Kei Iwai
Análises proteômicas
realizadas para diferentes grupos
de pesquisa no Instituto Butantan
desde 2013.

 

Análises proteômicas
realizadas para diferentes
grupos de pesquisa na cidade
de São Paulo desde 2013.

 

 

Análises proteômicas

realizadas para diferentes
grupos de pesquisa no Brasil
desde 2013.

Espectômetros

  • Q-TOF Ultima API
    (Waters) acoplado ao
    nano Acquity Ultra
    Performance LC (Waters)

  • MSQ-single
    quadrupole
    (Thermo)

  • LTQ-XL+ETD (Thermo)
    acoplado a um
    nanoLC Ultra 1D Plus
    (Eksigent)

  • LTQ Orbitrap Velos
    (Thermo) – nanoLC
    PROXEON EASY-nLCII
    (Thermo)